Все зависит от того, какие задачи вы ставите перед собой. Если рассматривать чисто со стороны приход, расход, возврат, считать остатки и провести инвентаризацию, то я для себя открыл Warehouse Open от компании Microinvest. Вот ссылка
http://warehouseopen.org/install-livecd-ru/. При все при этом мы получаем уже готовый продукт без мозгое.. и ан..<==3..ма. Лично я не админ, а просто владелец нескольких магазинчиков, то решил не платить Блину Гейцу ни копеечки. Да и 1С под мои задачи никак не нужен, тем более за такое бабло. А самое главное, что вся база крутиться под, известной каждому инет программеру, MySql.........