Вариант номер 1 - dd. Побайтное копирование, полная копия, сожрет столько места, сколько помещается на ваш / или hdd целиком, в зависимости от того, что бекапить.
Вариант номер 2 - tar. Займет столько места, сколько занято на диске. Grub придется все же переустановить.