разделы на флешке перекрывают друг друга

[andytux]

это мог быть вирус?

Сколько существуют компьютеры - столько существует легенда о вирусах убивающих компьютеры.
Впрочем не все так фантачтично. Вполне возможно.
Но ориентируясь на скорость записи, вполне возможная причина - некачественная флеш-память.
Если интересно, попробуйте писать на разные участки памяти (как: читайте man dd ).
Сейчас полно "фуфла" (даже только из магазина) на которое пишет ели-ели. Причем местами может писать с нормальной скоростью, местами падает чуть не до нуля.
Для ориентира. Лет 10 назад нормальной скоростью для флешки было ~10мб/сек.

[Ros80]

Как вариант мне помогало
Код: [Выделить]

sudo parted /dec/sdb

и далее
Код: [Выделить]

mklabel msdos

т.е пересоздание твблицы разделов

rost@samsung:~$ sudo parted /dev/sdb
GNU Parted 3.2
Используется /dev/sdb
Добро пожаловать в GNU Parted! Наберите 'help' для просмотра списка команд.
(parted) mklabel msdos                                                   
Предупреждение: Существующая метка диска на  /dev/sdb будет уничтожена и все
данные на этом диске будут потеряны. Действительно продолжить?
Да/Yes/Нет/No? y                                                         
Ошибка: Ошибка ввода/вывода во время записи на /dev/sdb
Повторить/Retry/Игнорировать/Ignore/Отменить/Cancel?       
видать кранты все ж флешке

[cargan]

Ros80, ну если Вы читаете флэш, то она в норме
** у вас установлен бит запрета записи на флэш,
здесь тема где об этом было обсуждение с подобной проблемой