у вас там не все записи.
сравните хотя бы по количеству:
у вас 5 строк
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/bind9/** m,
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/ldb/** m,
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/ldb/modules/ldb/** m,
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/gensec/krb5.so m,
/usr/lib/samba/private/dns.keytab rwk,
в инструкции 10 строк
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/bind9/** m,
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/ldb/** m,
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/ldb/modules/ldb/** m,
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/gensec/krb5.so m,
/var/lib/samba/private/dns.keytab rwk,
/var/lib/samba/private/named.conf r,
/var/lib/samba/private/dns/** rwk,
/var/lib/samba/private/krb5.conf r,
/var/tmp/** rwk,
/dev/urandom rwk,
и нет как раз записей разрешающих доступ к /usr/lib/x86_64-linux-gnu/ldb/modules/ldb/*
и откуда вы взяли /usr/lib/x86_64-linux-gnu/samba/ldb/modules/ldb/** m, ?