1. Поддержка 12.10 закончилась. Репозитории недоступны. Переходите на 14.04 LTS или на 12.04 LTS (она будет актуальна ещё 3 года).
2. Смотря как устанавливали видео-драйвер. Если из отдельного репозитория или через "Установку драйверов" ("Драйверы"), то с большой вероятностью драйвер сохранится. Если скачивали с сайта файлом, то с такой же вероятностью - слетит.
3. Так же важно знать, что у вас за видео-карта (или встроенное видео). В некотрых случаях при обновлении ядра системы и X-сервера вполне можно остаться без графики. Но случай редкий. Покажите вывод Терминала на команду:
lspci -knn | grep VGA -A2
- расскажет о видео-подсистеме.
А так же, какая версия ядра:
uname -r
4. Да, некоторые программы заменяются на более новые версии.
5. По-идее, личные файлы пользователя не должны быть затронуты. Если "Домашняя папка" стоит на отдельном разделе диска, то тогда все данные сохраняться, если этот раздел не форматировать (а при обновлении он и не форматируется).
Покажите вывод команд:
sudo blkid
sudo fdisk -l
Но через несколько обновлений (12.10 - 13.04 - 13.10 - 14.04) может случится всё что угодно. Не факт, что вообще пойдёт обновление - половина версий уже не поддерживается.
Рекомендую сразу ставить 12.04 или 14.04 с форматированием /-раздела, но без форматирования раздела /home. Главное - введите при установке тоже имя пользователя и задайте такой же пароль, как и были.