Только если они были перезаписаны где-то ещё.
Либо X-сервер был кастомный без дебиан патчей.
AnrDaemon, скорее всего вы меня не понял, а я уж точно не понял вас. Я говорил о конфигах, отказывающихся работать в папке /etc/X11/xorg.conf.d/ на обычной Kubuntu, но работающих в папке /usr/share/X11/xorg.conf.d/ на ней же. Правда эти конфиги были связаны не с тирингом.
Вспомнился анекдот.
Спрашивают диктора:
— Как с такой дикцией вас взяли на радио? У вас там что, блат?
— Почему блат, сестла.