До этого использовал Юнити и использовал другой аудиоплеер. Обновил систему и так получилось, что и плеер новый решил попробовать. Поэтому связать эту проблему не могу точно с окружением, но все же.
Установил Audacious, закрепил его в доке. Теперь при запуске у меня в доке остается моя закрепленная иконка и появляется вторая - запущенного приложения. Это косяк Гнома или Audacious? Просто тот же закрепленный Наутилус же не запускает вторую копию иконки своей.
Иконку из главного меню выбирал и ПКМ - закрепить в доке.