ТС, во-первых можете поставить себе Lubuntu она потребляет меньше ресурсов. Если глючит Ubuntu Software (а это бывает) поставьте себе менеджер пакетов Synaptic - у меня он не подвисал.
Если окно становится серым попробуйте запустить терминал, набрать xkill и навести курсор на зависшее, окно, кликнуть на нём. Это убьёт процесс.