Размер sda1 - 512МБ, занято около 6МБ.
Переустанавливали потому как было неясно что вообще происходит) ОС ломалась каждый день.
Сейчас нашли временное решение - задали системе при каждом перезапуске машины прогонять fsck для профилактики. По крайней мере, пока инцидентов больше не случалось.