У меня, а потом ещё у нескольких человек, была подобная проблема с Mandriva 2007.
Оказалось, проблема с недобитым 3D. Точнее с compiz. Повставляют всяких свистелок, которые нормально не работают, а потом всё и глючит.
Я просто отключил "3D-эффекты рабочего стола". В /etc/X11/xorg.conf не смотрел, просто отключил из GUI.