ploop, в идеале хочется не засорять панель и рабочий стол...
К тому же, если сравнивать по занимаемому пространству, то на UNR разницы особой нет, держать апплет или приложение открытым. Пожалуй, приложение даже удобнее будет -- не надо каждый раз ждать, пока оно загрузится.