wtor,
1. Писать sudo в команде запуска бесполезно, т.к sudo работает в инерактивном консольном режиме принимая введенный пароль от пользователя.
2. ЕМНИП "Автоматически запускаемые приложения" запускаются с правами юзера, поэтому прописывать туда скрипт которому нужны права root также бесполезно.