У меня аналогичная проблема. И неисправности железа здесь ни при чем. На трех компьютерах стоит Ubuntu 9.10, но подвисание операционной системы только на одном, и не на самом слабом. При чем подвисает на нем только Ubuntu 9.10 и 9.04. ВинХР и Ubuntu 8.10 и ниже работают нормально. Так, что думаю, что дело в ядре. Но как с этим бороться не знаю. Сначала думал что это Огненный Лис так себя ведет, но потом убедился, что это не он, да и любые другие приложения здесь ни при чем. Виснет сама ОС, в том числе и монитор, если запущен. От драйвера видеокарты, Компиз также зависимости не заметил.
Форум увели почему-то в сторону, от обсуждаемой темы. Что касается БИОС, то новее для моего ноутбука нет. Просто не знаю что делать. На старых версиях ОС работать не хочется, там и все приложения более старые, а Убунти 9.х работает явно некоректно. Ноутбук Асус А6, Пентиум М745 1,7Г, 1Г ОЗУ.