А вы какие репы добавили?
Добавлял так:
sudo apt-get install owncloud-client
А зачем Вы клиент-то ставили?
Вам же сервер нужен!
sudo apt-get install owncloud
Ставите, проходите в вебморду и проходите процедуру первой иннициализации.
При этом будет запрос какую б/д использовать. Выбираете свою, да и всё. Вводите логин/пасс базы и готово.
Не понимаю, в чём сложность?
Репу Вы добавили верно вроде. - нет, и здесь не верно.
Так, поехали:
Добавляем репу (для сервера на ubuntu 16/04!):
sudo sh -c "echo 'deb http://download.owncloud.org/download/repositories/stable/Ubuntu_16.04/ /' >> /etc/apt/sources.list.d/owncloud.list"
Скачиваем и добавляем ключ:
wget -nv https://download.owncloud.org/download/repositories/stable/Ubuntu_16.04/Release.key -O Release.key
apt-key add - < Release.key
Обновляем содержимое реп и ставим сервер:
sudo apt-get update && sudo apt-get install owncloud
Далее входим в вебморду:
Ваш адрес/owncloud и проходим процедуру установки.
Б/Д установлена уже?