Хм... Ну нет у меня Юнити, но на всех дистрибутивах работает.
Alt-F2 - должно появится текстовое окошко, в нем набираешь xkill - это программка, убивающее Х-приложение. Появляется вместо курсора мышки крестик, наводишь его на зависшее приложение, щелкаешь левой кнопкой мыши.