Запусти дефолтный убунтоский Xsane, а он даж автосохранять картинки не умеет.
Не верю.
Пользуюсь тем самым xsane, прекрасно он называет картинки, и именно по типу Изображение-1, Изображение-2, ...
Умеет сканировать в многостраничный tiff, с автоподатчиком работает, скармливаешь сканеру пачку бумаги, клацаешь "сканировать", и собсно все, отсканирует все, и аккуратно пронумерует изображения по порядку. Что еще автоматизировать нужно?
Внимательно посмотри на основное окно, там все есть.