Если я правильно понял, то хочется иметь кнопку на десктопе, которая монтирует то что нужно, и запускает торрент клиент из под текущего пользователя. В этом случае сия строка
gksu -u username transmission &
является полным бредом.
Нужно сделать скрипт следующего вида
#!/bin/sh
gksudo mount ...
transmission
Обрати внимание на первую строчку и на отсутствие амперсантов.
Сделать на него chmod +x и создать ярлык на десктопе в котором в поле команды для запуска указать путь к этому скрипту. Если это не противоречит политике безопасности, то лучше вообще убрать gksudo/sudo и прочих и добавить в fstab noauto,user к опциям монтирования нужного диска. тогда его можно будет монтировать без рутовых прав, и скрипт этот можно будет вместе с самим гномом запускать без вмешательства пользователя.