Skype и так нормально работает. Для начала с него хотят научиться получать прибыль, чего бывшим владельцам не сильно удавалось. А потом уже думать о .NET и нативном х64.
Интересно как будут решать работу на интеловских процессорах с повышенным энергосбережением? Там не во всех есть х64.
Да и патч для работы с бОльшим адресным пространством, могли бы все таки запилить еще во времена 2003. Как сейчас помню, держишь в руках диск с 2003 х64 и думаешь как бы туда русский\украинский MUI вставить. Потому как сервер терминалов, а пользователям нужен родной язык.