Multik001, я не особо разбираюсь в виртуальных файловых системах (?) типа NFS, но знаю, что ssh (а, следовательно, и sftp) - "родной" Линуксу протокол. Он всегда будет работать стабильно, его никогда не выпилят, им можно пользоваться через интернет (он шифрованный). Так что, наверное, дело привычки. ssh доступы по ключу я всё равно настраиваю везде и всегда, поэтому этот протокол просто бонусом идёт к ним.
Возможно, он медленнее, чем NFS (за счёт шифрования), а возможно и нет (сейчас ЦП уже далеко шагнули). Я не изучал вопрос скорости.