А с этого места можно по подробней. Что-бы в дальнейшем повадно небыло
Я уже выше всё сказал. Если вам нужен бэкап - бэкапьте нормально. А не изобретайте средства, которые "ну точно должны работать. Ну в самом деле, что может пойти не так?"
Дропбокс, это в основе своей система распределённой синхронизации файлов.
База данных является файлом, только когда ты останавливаешь сервер. Во время работы тонна информации просто не доходит до диска, откуда она может быть получена rsync'ом, либо доходит в произвольном порядке. Любая попытка снять копию на файловом уровне с большой вероятностью приведёт к созданию нерабочей копии и с приличной вероятностью - к сбою в работе сервера, что может закончиться убийством оригинальной базы.