sudo apt update
запрос информации о пакетах из репозитория.
sudo apt upgrade
обновление пакетов
sudo apt dist-upgrade
обрабатывает изменение зависимостей с новыми версиями пакетов и при необходимости пытается обновить наиболее важные пакеты за счет менее важных. Таким образом, в отличие от этого apt-get upgrade , apt-get dist-upgrade команда может фактически удалить некоторые пакеты в необходимых случаях.
Что мы и наблюдаем.
Попробуйте выполнить следующие команды
sudo dpkg configure -a
исправление сломанных пакетов
sudo apt install -f
то же
sudo apt clean && apt autoclean
очистка кэша пакетов и удаление не нужных пакетов
sudo apt update && sudo apt upgrade
безопасное обновление
Если имеются левые репозитории и ppa их лучше отключить