zames, Ты хозяин своего компьютера, и ты только ты, решаешь когда позволить приложению использовать дискретную графику. Без твоего ведома задействовать дискретную графику ни ОС ни приложение не может (при использовании bumblebee). Точно так же, ты и только ты решаешь, запускать ли приложение с дискретной графикой через командную строку, или настроить свойства ярлыка, что бы это происходило по умолчанию с определенными приложением с дискретной графикой. И мне кажется это достаточно чётко описано в инструкции, странно, что вам это не понятно...