Неправильный подход. Вы не получите никакого толка от SSD, если будете работать с ним как описали. То, что система и все программы + конфиги должны быть на SSD - это само собой.
У меня на SSD один раздел под рут и домашнюю папку. HDD монтирую в домашнюю и храню там в основном медиа файлы, торренты, архивы и то, что используется очень редко, и что просто не имеет смысла держать на SSD. А все, что должно часто читаться/писаться/перезаписываться - на SDD. Там же и все рабочие файлы, которых немало. А чтобы использовать папки в домашней директории (Загрузки, Видео, Музыка, Документы) по назначению, но не забивать SSD - я перенес их на HDD, и в домашней папке создал на них симлинки.
Никакой ручной "оптимизации" не делал. Разметил на SSD один раздел btrfs (автоматом создается два подтома для корня и домашней папки). Единственное, что делал - это включил сжатие lzo для раздела (это не обязательно и однозначно сказать нельзя, стоит его включать, или нет), да отключил cow для папки с образами виртуальных машин. Но это все специфично для btrfs, на том же ext4 этого делать нет нужды. Никакие кеши браузеров и т.п. никуда не выносил, т.к. не вижу смысла.
Я специально считал, на сколько мне хватит SSD при таком использовании, учитывая средний объем записи в день и ресурс на сайте производителя - вышло около 20 лет. Ей-богу, у меня нет ни одного HDD, который бы и 10 лет отработал. Ваш SSD скорее всего морально устареет, и вы его просто замените другим, чем он выработает свой ресурс.