Похоже косяк был действительно в флешке.
Хоть она и была отформатирована в FAT, и при этом использовалась исключительно для установки операционок, но при попытке записать на неё новый образ привел к появлению всех этих ошибок.
Но при этом смог я все же смог записать на неё образ на с помощью LiLi.
На другую флешку спокойно записал образ через Универсальный инсталятор, без каких либо ошибок.
Ребят, всем спасибо.