Сохрани папку home на внешний жесткий диск. В ней хранятся все твои настройки, ну, или почти все. Когда установишь ось с нуля, просто подменяй папки программ папками программ с твоего старого home. Как вариант, вообще подмени свежеустановленный home старым home. Я ни разу так не делал (боюсь), но, по идее, должно получится то же самое.