В общем, сколько людей, столько мнений, но собственно нет ни одной объективной причины ставить i386 системку. Если новый проц и новый комп, то определённо стоит поставить и заточенную под него ОСь. Преимущества у 64 битки в основном в скорости работы с архивами, в скорости декодирования всего чего угодно и проч. Недостатки - пара-тройка экстравагантных пакетов, которых нет по умолчанию для х64. Да, и есть либы ia32, которые обеспечивают (часто) совместимость с 32-битными приложениями. Так что ставьте x64 и не парьтесь!