я вполне себе представляю, что делает fstrim. Два раза и более вызывать его - нет необходимости. Происходит это на btrfs с подтомами, прописанными в fstab. Записи разные, а диск - один. Парсер fstrim -A просто проходит по всем записям, не обращая внимание на то что две, три, пять, двадцать записей в fstab могут быть одним ssd-диском.