3.9.1 стоит. Последняя. Она, разве, не включается в себя все предыдущие?
Грубо говоря - нет. Но мягко выражаясь... Вот ты искал /usr/bin/env, так заодно и глянул-бы, какой у тебя питон. Вероятней всего, ты там увидишь "python3", что никак не соответствует:
/usr/bin/env: «python»: Нет такого файла или каталога
Это питон второй версии. С третьей друг в друга они не включаются. Некоторое время устанавливались обе ветки. Сейчас, по умолчанию, только третья.
Самое простое и безопасное, можно попробовать сделать симлинк python, указывающий на python3.
А вообще, шутки с питоном чреваты поломкой системы. Таких тем на форуме немало.