попробуй удалить update-manager
apt-get autoremove update-manager*
ребутнутся и сразу после загрузки глянуть free в терминале.
~$ free -h
total used free shared buffers cached
Память: 3,8G 2,3G 1,5G 264M 82M 1,0G
-/+ буферы/кэш: 1,2G 2,6G
Swap: 3,8G 0B 3,8G
У меня в данный момент на буке с 4Г хавается 1,2Г.
Мб ты смотришь не туда, например на 2,3Г - что есть потребление ОЗУ вместе с кэшем.