Собственно проблема в заглавии темы:пропали значки запущенных программ в верхней панели, в частности Telegram и Transmission. Кто-то может ещё с этим столкнулся? Гугл и форум курил - ответов не нашёл.
Решение проблемы: Нажмите сочетание клавиш Alt+F2, введите r и нажмите Enter. Значки должны появиться.
Взято отсюда:
http://compizomania.54672.x6.nabble.com/-td6642.html#a6646