Если вы про апплет dockbarx, не будет он в Мате работать.
Ему требуется пакет gnomeapplets (если я не ошибаюсь), которого в Мате нет и не будет.
Поэтому есть три варианта:
1. Использовать Cinnamon с
вот этим апплетом.
2. Использовать Gnome Shell (для него тоже есть какое-то дополнение такое).
3. Использовать дополнительный док (AWN (с апплетом dockbarx) или dockx, который ставится вместе с dockbarx).
От себя добавлю, что Гном Шелл мне не нравится, Циннамон глючный, дополнительные доки я никогда не использовал и не буду использовать.
Потому я пока съехал на винду - подожду, пока циннамон допилят до удобоваримого состояния.
Без такого активного таскбара вообще не могу работать.