Чего тут странного? Бывают глюки в линуксовых утилитах, можно напороться на то, что разные утилиты показывают разный тип разметки. Где-то остаются какие-то хвосты, скорее всего, хотя я не знаю, почему так происходит. Я бы чистил диск с diskpart в windows, оставил неразмеченным и запускал установку.
Ps как-то на форуме тут выкладывал скрины и описывал, как воспроизвести. У меня получалось в разных утилитах разная разметка.