gvozdb,
пробуй запустить с правами root:
sudo gtkpod
Я немного обманул в прошлом сообщении. Песня в gtkpod закидывается, она видна из gtkpod, а когда я жму "Извлечь" в этом софте, то он мне пишет "Unsupported checksum type", приходится извлекать ипод через долфин. В итоге на иподе нет закинутых песен. Я так понимаю, что они есть, но не видны. Потому что действия какие-то таки gtkpod совершает. Например удалять композиции он умеет, хотя некорректно, правда. Он просто удаляет песню, а информация о ней в иподе остаётся. И при попытке воспроизвести её на иподе - он мне переключает на следующую. Я так понимаю, это от того, что он найти её не может физически.
Кстати и gtkpod, и clementine запускать пробовал и через root, и обычным образом. Всё одно: "Unsupported checksum type"...