На данный момент ситуация такая:
Берёте КриптоПРО 5 + chromium gost + КриптоПРО браузер плагин.
Этого достаточно для работы на ЕИС. С КриптоПРО 5 в Linux даже начинающий разберётся.
Она имеет нормальный графический интерфейс и, как в 4 версии, не надо гонять длиннющие комманды для установки всех сертификатов. Всё делается в GUI.