denis_x, сторонние программы - это не включённые в DE (рабочее окружение). При этом они могут поставляться как через стандартные репозитории ("Центр приложений"), так и через собственные репозитории, подключаемые пользователем самостоятельно.
О, уже ответили.
denis_x, более того. Мне однажды понадобился один плагин для GIMP, а он работал в только в новой версии GIMP, а новая версия GIMP работала только в новой версии ОС.