почему косячный дистрибутив, залитый UUI совсем не работал
В какой-то мере я тебе уже ответил:
Все остальные варианты зависят от того, что под ними подразумевает и как реализует каждая конкретная программа.
что тип файловой системы диктуется именно заливаемым образом и не столь важно в каком формате флешка была до заливки
Это верно как-раз для записи с помошью dd.
важность форматирования флешки перед заливкой в него образа из iso.
Не важно, что было на флешке, как отформатирована. dd все перезапишет. Получится именно та, файловая система, что в записываемом образе.
Для всех остальных вариантов нужно рассматривать в каждом конкретном случае. Но вот после dd, как минимум, желательно заново создать таблицу разделов и необходимые разделы.