У меня такая проблема была но ноуте с 2Гб памяти на релизе 11.04 и свапе в районе 2Гб. При серьезном аптайме засиралась сначала память, а потом и свап до упора и система начинала тормозить. В основном я так понял это проблема подтекающих приложений, один только лаунчер docky у меня разрастался до 200 метров.
11.10 32б только поставил и пока не могу сказать как он себя поведет. Для себя решил, что если памяти 2Гб или меньше - ставь 32-битную систему и не парь мозги.
Если хочешь проверить эту догадку - перезагрузи и отключи swap командов swapoff. Будет работать зашибись пока хватит оперативы.