AnrDaemon,
JPerf пробовали двух версий с товарищем по работе (у меня дома нет винды, по вайном тест некорректный), для чистоты эксперимента - тест Windows - линукс . IPerf запускался в терминале винды два верхних результата IPerf (win)- Iperf (linux), два нижних JPerf (win) - Iperf (linux). Это максимальный разброс в скоростях. Помимо этого, при тестах (с использованием жаба-перфа) проявляется нестабильность в результатах измерений. При использования Iperfa (без гуя) - результаты стабильны, разница в измерениях 1-3 мбит/сек.
При тестировании скорости vlan используем именно iperf, на винде, без гуёв.
Интересно было бы услышать ТС.