Итак, я - Господин Соврамши.
Однако, не со зла, а исключительно по недомыслию.
Ошибка воспроизведена, и исследована.
Данное явление произошло не после обновления системы, просто так случайно совпало.
Цепочка проблем и глюков была следующая:
КUbuntu 8.04 на ноутбуке с АТИ Радеон Х1300 с проприетарными дровами, подключенный через сокс-прокси. Поскольку реализация прокси заработала относительно недавно, был установлен QIP 8030 под wine (как самый удобный мне мессенджер), и был установлен Compiz и Emerald - не скажу, что были шибко нужны, но работало, и было все хорошо.
Пока не пришлось поменять QIP на версию 8070 (как и всем пользователям оного). Дальше начались глюки: при работе в Редакторе Текстов ОпенОфиса (и только в нем) при получении нового сообщения окошко с сообщениями пропадало, и обратно его можно было получить только перегрузив QIP. Поскольку было это неудобно, была попытка отключить Компиз через CompizFusion Icon (по совету на каком-то из рессурсов по установке Компиза).
Вот именно в этот момент и исчезла та самая полоска и Райтер стал мигать!
Самое интересное, что НИ В ОДНОМ другом приложении этого не произошло, перезагрузка не помогала, но зато перестали пропадать окна QIP.
Так что выходов было найдено два - установка Лиски и снесение Компиза...
Полностью.