Поперла тема у самого 7.04+LTSP+xfce desctop
С буковками разбирались на форуме, но только для обычного десктопа...
Понимаю, что надо рыть в сторону поиска скриптов отвечающих за формирование файла fstab во временном каталоге пользователя LTSP и править его с целью чтоб он вписывал кодировку русскую (как временное решение проблемы)
Для того чтоб не парится с новыми клиентами есть /opt/ltsp/i386/etc/skel
Методология такая - настраиваешь одного юзера и в эту директорию помещаешь настройки которые будут у нового юзера, включая симлинки на общие папки права и обязанности
...