keyring manager где-то хранит информацию о том, каким приложениям и при каких условиях можно давать доступ к брелокам. Где точно не знаю, но чем-то чувствую, что либо в дом.каталоге пользователя, либо в gconf. Вообще он обычно, когда первый раз спрашивает пускать ли приложение в брелок, больше вариантов предлагает, там есть вариант "всегда разрешать", тогда при запуске этого приложения, его автоматом пускают в брелок. Мне кажется, нужно найти где оно хранит эти настройки и убрать оттуда настройки для network manager, тогда при следующем обращении keyring снова спросит что делать...
Кроме того в настройках самого keyring manager устанавливаются правила блокировки брелока, типа: "не блокировать 5 минут", "не блокировать до конца сессии". Формулировки, естественно, не точные, нет ubuntu под рукой. Можно ими ещё поиграть, чтобы брелоки не блокировались в течение сессии или просто задержку побольше поставить...
вот как-то так...