в системе и Network Manager появился дублирующий интерфейс
- т.е. в трее висит два значка, или что-то другое имеется ввиду?..
Если два значка, то смотри в
Автоматически запускаемых приложениях, возможно отвечающий за это апплет, там прописан дважды... если все же он там не дублируется, то попробуй настроить его запуск с задержкой на 3-5 сек.
ЗЫЖ не уверен, что описанное выше годится для Гнома, но в Ubuntu MATE в какой-то из предыдущих версий это помогало