э-э-э-э.
А в чем проблема то? Какие там партишн-меджики и прочая фигня.
$ sudo fdisk /dev/sda
А дальше пошли
Команда t (изменить id раздела). Выбираем 3 раздел, ид раздела 7 (ntfs).
Можно и линуховому поменять, но скажу как, линукс откровенно ложил на эти id.
Команда t (изменить id раздела). Выбираем 2 раздел, ид раздела 83 (Linux).
Команда w (записать новую таблицу).
Почему fdisk'ом можно убить данные, я не знаю. Все отлично работает, главное понимать что делаешь.