Какая версия Ubuntu?
У меня в 12.04 его просто нет. Это если вы имеете ввиду системный трей в правом углу верхней панели.
Если же вы имеете ввиду Лаунчер (левую боковую панель), то убрать просто: навести мышку на нужный значок, нажать правую клавишу мыши и в контекстом меню выбрать "Изъять из панели". В 12.04 так.