Итак, за прошедшее время я перепробовал многое для решения своей проблемы:
1. Принудительно ставил дискретную видеокарту как первичное и единственное видеоустройство. Не помогло.
2. Искал процесс, который при запуске ос грузит одно из ядер, так что вся система подтормаживает (описание чуть выше какие проблемы), а после режима сна он куда то пропадает и все работает хорошо. Не нашел в итоге. Искал командой top в терминале
3. Отключал анимацию. Не решило моей проблемы.
4. В биосе хотел настройки энергосбережения перенастроить, но в моем биосе почему то даже вкладки нет для таких настроек. Опять безрезультатно и тут.
Что ещё могу сделать чтобы причину подтормаживаний как то найти и исключить ее? Кроме регулярного переводна в режим сна.