Но как я понял это касается только самого ядра системы и не затрагивает набор софта,как мне тогда включить нужный софт и закатать полученное в один дистрибутив?
Ну да, в статье тока про ядро говорится. Что касается софта, то есть несколько вариантов. Либо через тот же самый Remastersys, о котором я говорил сделать. Т.е. установить нужное вам ядро и софт, а потом создать через эту прогу установочный диск. Установка стандартная, тока весь софт и прочие пакеты будут те же, что на вашей системе в момент бэкапа. Там даже раздел home можно забэкапить, так что по идее даже настройки софта должны сохраняться (не проверял).
Второй вариант - использовать проги для создания своей сборки вроде Reconstructor или Ubuntu Customisation kit и через них поставить нужные пакеты. В реконструкторе кстати есть возможность делать все ручками через chroot - так мне кажется даже удобнее. Впрочем через chroot можно по идее и просто из консоли пакеты добавлять, без реконструктора, но я этого никогда не делал, потому процедуры не знаю и советовать не могу.
Вот, что мне на вскидку в голову пришло. Может более опытные коллеги подскажут и что-то еще.
А, забыл. Есть целая туча софта (и даже онлайн-сервисов) по сборке дистра, Они не такие продвинутые, как вышеперечисленные проги, но по идее там тоже должна быть функция добавления пакетов. Погуглите на эту тему.