Видимо ошибки на виртуальном диске, которые остались и в резервной копии. Когда я подключаю виртуальный диск к другой ВМ и проверяю его там fsck - все ок, а когда запускаю fsck изнутри ВМ из резервной копии - отображаются ошибки.
Пользователь добавил сообщение 17 Июня 2019, 10:09:37:
$ sudo lsof +D /var/lib/mysql/
COMMAND PID USER FD TYPE DEVICE SIZE/OFF NODE NAME
mysqld 16299 mysql cwd DIR 8,2 32768 528939 /var/lib/mysql
mysqld 16299 mysql 4u REG 8,2 80 565478 /var/lib/mysql/binlog.index
mysqld 16299 mysql 5uW REG 8,2 50331648 534909 /var/lib/mysql/ib_logfile0
mysqld 16299 mysql 10uW REG 8,2 146800640 529879 /var/lib/mysql/ibdata1
mysqld 16299 mysql 11uW REG 8,2 50331648 566048 /var/lib/mysql/ib_logfile1
mysqld 16299 mysql 12uW REG 8,2 23068672 548419 /var/lib/mysql/undo_001
mysqld 16299 mysql 14uW REG 8,2 25165824 548423 /var/lib/mysql/undo_002
Файлы, которыми в данный момент занимается mysql.