Пременной MC_KEYMAP не определена ни для root'а, ни для пользователя, файла ~/.config/mc.keymap нет у обоих,
параметра keymap в ini-файле нет у обоих, файл /usr/share/mc/mc_keymap отстствует, есть только /etc/mc/mc.keymap->mc.default.keymap.
Ещё у пользователя есть ~/.mc, но пустой. Т.е. различий нет.