Вам повезло, что процесс завершился без ошибок. Программа не просто так ругается - она предупреждает, что операции, используемые в перемещении разделов, никакого отношения к файловой системе на разделе не имеют, и её целостность будет нарушена, если перемещение не удастся по любой причине. Причём ни продолжить, ни отменить операцию в этом случае будет невозможно.