Проблема в том что производители LabView сильно отстали от жизни. У меня в kubuntu 6.10 стоит glibc2 версии 2.4 они требуют 2.1.x. Видимо за 3 версии где-то потерялась обратная совместимость. На дебиане запускалось потому что sarge достаточно старый дистрибутив и там более ранняя версия glibc2.
Скорей всего для нормального запуска программы достаточно собрать её на более свежей системе, так как подозреваю, что несовместимость именно в бинарных файлах (может имя какого то символа изменилось или ещё что). Так как производитель сорцы не даёт, то этот вариант отпадает.
Как я понял из написанного про LD_ASSUME_KERNEL (я не особо вникал и не читал доп. информации поэтому могу заблуждаться), эта переменная используется динамическим загрузчиком при открытии .so для того чтобы открывать библиотеки скомпилированные на системе с более ранней версией ядра. Кстати, вы пробовали этот метод?
Я не уверен в возможности установить более раннюю версию glibc в параллель и запускать LabView указав в переменной LD_LIBRARY_PATH путь к старой версии glibc до пути к текущей. Такой вариант точно не получится сделать стандартными средствами (apt-get install). Возможно стоит спросить у создателей продукта, о работе их программы в системе с glibc 2.4.